为什么要polya富集
PolyA富集是一种用于转录组学和空间转录组学中的mRNA捕获技术,其核心原理是mRNA分子的3'末端通常具有PolyA尾巴(一串腺苷酸)。通过使用带有互补序列的寡核苷酸探针(例如带有polyT序列的探针)与这些PolyA尾巴结合,可以有效地捕获mRNA分子。以下是PolyA富集的主要优势:
操作简便:
由于几乎所有的mRNA都具有PolyA尾巴,捕获过程相对统一,易于操作。
适用性广:
PolyA捕获技术适用于各种样本类型,包括新鲜冷冻组织和FFPE(甲醛固定、石蜡包埋)组织。
高通量分析:
可以同时捕获大量的mRNA分子,适合进行高通量分析。
然而,PolyA富集也有其局限性,例如可能无法捕获不具有典型PolyA尾巴的mRNA分子,如某些非编码RNA或特殊类型的mRNA。
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